MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 2501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011991	TGAC	2	8	76779	76786	25 %	25 %	25 %	25 %	222109189
1502	NC_011991	GGT	2	6	76821	76826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109189
1503	NC_011991	ACG	2	6	76845	76850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109189
1504	NC_011991	T	6	6	76857	76862	0 %	100 %	0 %	0 %	222109189
1505	NC_011991	CTGTT	2	10	76901	76910	0 %	60 %	20 %	20 %	222109189
1506	NC_011991	AG	4	8	76935	76942	50 %	0 %	50 %	0 %	222109189
1507	NC_011991	AT	3	6	76961	76966	50 %	50 %	0 %	0 %	222109189
1508	NC_011991	A	6	6	77072	77077	100 %	0 %	0 %	0 %	222109189
1509	NC_011991	A	6	6	77096	77101	100 %	0 %	0 %	0 %	222109189
1510	NC_011991	CGG	3	9	77140	77148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109189
1511	NC_011991	GCC	2	6	77157	77162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109189
1512	NC_011991	CAT	2	6	77297	77302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109189
1513	NC_011991	AGGC	2	8	77323	77330	25 %	0 %	50 %	25 %	222109189
1514	NC_011991	CG	3	6	77355	77360	0 %	0 %	50 %	50 %	222109189
1515	NC_011991	CAA	2	6	77378	77383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109189
1516	NC_011991	GCT	2	6	77412	77417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109189
1517	NC_011991	TCG	2	6	77430	77435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109189
1518	NC_011991	CT	3	6	77563	77568	0 %	50 %	0 %	50 %	222109189
1519	NC_011991	CGT	2	6	77706	77711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011991	GCA	2	6	77757	77762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011991	CGT	2	6	77797	77802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109190
1522	NC_011991	TCG	2	6	77807	77812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109190
1523	NC_011991	CAAT	2	8	77879	77886	50 %	25 %	0 %	25 %	222109190
1524	NC_011991	ACA	2	6	77905	77910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109190
1525	NC_011991	TGC	2	6	78004	78009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109190
1526	NC_011991	CTT	2	6	78058	78063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109190
1527	NC_011991	GTT	2	6	78115	78120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109190
1528	NC_011991	ACCTC	2	10	78245	78254	20 %	20 %	0 %	60 %	222109190
1529	NC_011991	CG	3	6	78259	78264	0 %	0 %	50 %	50 %	222109190
1530	NC_011991	CCT	2	6	78272	78277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109190
1531	NC_011991	GTT	2	6	78353	78358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109190
1532	NC_011991	CG	3	6	78381	78386	0 %	0 %	50 %	50 %	222109190
1533	NC_011991	GCC	2	6	78388	78393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109190
1534	NC_011991	GCA	2	6	78466	78471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109190
1535	NC_011991	ACA	2	6	78564	78569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109190
1536	NC_011991	CCAAT	2	10	78609	78618	40 %	20 %	0 %	40 %	222109190
1537	NC_011991	A	7	7	78704	78710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011991	AT	3	6	78761	78766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011991	TAA	2	6	78850	78855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109191
1540	NC_011991	GAT	2	6	78901	78906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109191
1541	NC_011991	GCA	2	6	78966	78971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109191
1542	NC_011991	TTC	2	6	78986	78991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109191
1543	NC_011991	TCA	2	6	79031	79036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109191
1544	NC_011991	ACC	2	6	79096	79101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109191
1545	NC_011991	TGC	2	6	79132	79137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109191
1546	NC_011991	CGA	2	6	79209	79214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109191
1547	NC_011991	TGT	2	6	79251	79256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109191
1548	NC_011991	TACG	2	8	79320	79327	25 %	25 %	25 %	25 %	222109191
1549	NC_011991	ATG	2	6	79403	79408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109191
1550	NC_011991	GAG	2	6	79427	79432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109191
1551	NC_011991	GGGA	2	8	79579	79586	25 %	0 %	75 %	0 %	222109191
1552	NC_011991	TAC	2	6	79618	79623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109191
1553	NC_011991	GAC	2	6	79643	79648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109191
1554	NC_011991	CTG	2	6	79651	79656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109191
1555	NC_011991	T	6	6	79736	79741	0 %	100 %	0 %	0 %	222109191
1556	NC_011991	GA	3	6	79796	79801	50 %	0 %	50 %	0 %	222109191
1557	NC_011991	A	7	7	79810	79816	100 %	0 %	0 %	0 %	222109191
1558	NC_011991	TG	3	6	79851	79856	0 %	50 %	50 %	0 %	222109191
1559	NC_011991	GGC	2	6	79944	79949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109191
1560	NC_011991	AGGA	2	8	80002	80009	50 %	0 %	50 %	0 %	222109191
1561	NC_011991	AAG	3	9	80017	80025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109191
1562	NC_011991	A	8	8	80084	80091	100 %	0 %	0 %	0 %	222109191
1563	NC_011991	CAC	2	6	80134	80139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109191
1564	NC_011991	GGGCC	2	10	80160	80169	0 %	0 %	60 %	40 %	222109191
1565	NC_011991	CG	3	6	80234	80239	0 %	0 %	50 %	50 %	222109191
1566	NC_011991	ATGA	2	8	80244	80251	50 %	25 %	25 %	0 %	222109191
1567	NC_011991	GC	3	6	80313	80318	0 %	0 %	50 %	50 %	222109191
1568	NC_011991	CAG	2	6	80323	80328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109191
1569	NC_011991	GAT	2	6	80431	80436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109191
1570	NC_011991	AAG	2	6	80507	80512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109191
1571	NC_011991	GGA	2	6	80538	80543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109191
1572	NC_011991	TGA	2	6	80592	80597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109191
1573	NC_011991	GAC	2	6	80630	80635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109191
1574	NC_011991	T	6	6	80667	80672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011991	GTG	2	6	80687	80692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011991	CG	3	6	80839	80844	0 %	0 %	50 %	50 %	222109192
1577	NC_011991	TGCT	2	8	80863	80870	0 %	50 %	25 %	25 %	222109192
1578	NC_011991	GC	3	6	81032	81037	0 %	0 %	50 %	50 %	222109192
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1583	NC_011991	ACC	2	6	81283	81288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109192
1584	NC_011991	GCT	2	6	81315	81320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109192
1585	NC_011991	CAAT	2	8	81504	81511	50 %	25 %	0 %	25 %	222109193
1586	NC_011991	CAT	2	6	81514	81519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109193
1587	NC_011991	CTT	2	6	81528	81533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109193
1588	NC_011991	CCG	2	6	81572	81577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109193
1589	NC_011991	TTC	2	6	81590	81595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109193
1590	NC_011991	AACA	2	8	81600	81607	75 %	0 %	0 %	25 %	222109193
1591	NC_011991	CGTT	2	8	81624	81631	0 %	50 %	25 %	25 %	222109193
1592	NC_011991	GAA	2	6	81689	81694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109193
1593	NC_011991	TCAA	2	8	81699	81706	50 %	25 %	0 %	25 %	222109193
1594	NC_011991	ACT	2	6	81713	81718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109193
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1596	NC_011991	GCA	2	6	81814	81819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109193
1597	NC_011991	A	6	6	81875	81880	100 %	0 %	0 %	0 %	222109193
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1599	NC_011991	TCA	2	6	81966	81971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109193
1600	NC_011991	GCT	2	6	81991	81996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109193
1601	NC_011991	TTC	2	6	82029	82034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109193
1602	NC_011991	GGC	2	6	82124	82129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_011991	T	9	9	82166	82174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011991	AC	3	6	82201	82206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_011991	TAG	2	6	82218	82223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011991	CGA	2	6	82225	82230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_011991	TTA	2	6	82254	82259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011991	GA	3	6	82286	82291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011991	TTG	2	6	82353	82358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011991	TGCGTG	2	12	82505	82516	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222109194
1611	NC_011991	TTG	2	6	82517	82522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109194
1612	NC_011991	AGGA	2	8	82532	82539	50 %	0 %	50 %	0 %	222109194
1613	NC_011991	CG	3	6	82557	82562	0 %	0 %	50 %	50 %	222109194
1614	NC_011991	GGCC	2	8	82631	82638	0 %	0 %	50 %	50 %	222109194
1615	NC_011991	GCG	2	6	82655	82660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109194
1616	NC_011991	GCG	2	6	82766	82771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109194
1617	NC_011991	GCT	2	6	82800	82805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109194
1618	NC_011991	A	7	7	82828	82834	100 %	0 %	0 %	0 %	222109194
1619	NC_011991	GGA	2	6	82925	82930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109195
1620	NC_011991	GC	4	8	82945	82952	0 %	0 %	50 %	50 %	222109195
1621	NC_011991	GCGG	2	8	82980	82987	0 %	0 %	75 %	25 %	222109195
1622	NC_011991	ACG	3	9	83070	83078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109195
1623	NC_011991	GCA	2	6	83086	83091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109195
1624	NC_011991	ATC	2	6	83172	83177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109195
1625	NC_011991	GAA	2	6	83210	83215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109195
1626	NC_011991	GCC	2	6	83222	83227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109195
1627	NC_011991	GAC	2	6	83234	83239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109195
1628	NC_011991	AAG	2	6	83286	83291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109195
1629	NC_011991	TCGA	2	8	83465	83472	25 %	25 %	25 %	25 %	222109195
1630	NC_011991	GCGATC	2	12	83501	83512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1632	NC_011991	AAG	2	6	83628	83633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011991	ATCG	2	8	83637	83644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_011991	GCCTC	2	10	83659	83668	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1998	NC_011991	GATG	2	8	103993	104000	25 %	25 %	50 %	0 %	222109208
1999	NC_011991	GA	3	6	104019	104024	50 %	0 %	50 %	0 %	222109208
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